Please use this identifier to cite or link to this item: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37972
metadata.dc.type: Dissertação
Title: Associação genômica ampla para identificação de genes candidatos relacionados com metabólicos proteícos em ovinos Santa Inês.
metadata.dc.creator: Souza, Taiana Cortez de
metadata.dc.contributor.advisor1: Pinto, Luís Fernando Batista
metadata.dc.contributor.referee1: Pinto, Luís Fernando Batista
metadata.dc.contributor.referee2: Camargo, Gregório Miguel Ferreira de
metadata.dc.contributor.referee3: Balieiro, Júlio César de Carvalho
metadata.dc.description.resumo: Níveis de albumina e ureia no sangue são usados como indicadores clínicos, bem como para avaliar o estado nutricional de um animal. Assim, o presente estudo tem por objetivo realizar análise de associação genômica ampla para dosagens de albumina e ureia em ovinos Santa Inês, a fim de identificar genes candidatos para essas variáveis. Um total de 320 cordeiros foram genotipados com o OvineSNP50 BeadChip. Após o controle de qualidade, 43.996 SNPs foram utilizados nas análises de associação via método ssGBLUP. Foram discutidas janelas que explicam pelo menos 1% da variância genética das dosagens de albumina e ureia. Oito regiões genômicas explicaram 11,6% da variância genética de albumina, sendo encontrados os genes candidatos ALDH7A1, GAPDHS, STRAP, MGTS1, EI24, HAMP, PTPRO, FFAR1, FFAR2, FFAR3, KIRREL2, ITGA8, NPHS1, TYROBP, MAG, DIABLO, PRODH2 e HPD. Sete regiões genômicas foram responsáveis por explicar 12,4% da variância genética de dosagem de ureia, sendo identificados os genes candidatos PCDH9, AZGP1, LAMTOR4, SMURF1, RAB31, ARPC1A, ARPC1B, CNTN1, PDZRN4, NDUFV2, CLOCK e NMU. A maioria destes genes candidatos estão envolvidos em processos biológicos relacionados com funções hepáticas e renais e podem conter variantes uteis ao processo de seleção de ovinos Santa Inês.
Abstract: Albumin and urea serum levels are used as clinical indicators, as well as to evaluate the nutritional status of an animal. Thus, the present study aims to performer a genome wide association study (GWAS) to identify candidate genes for albumin and urea levels in Santa Ines sheep. The GWAS analysis was performed with 320 lambs and 43,996 SNPs, using the ssGBLUP method. Regions that explain at least 1% of the genetic variance of the albumin and urea levels were discussed. Eight genomic regions explained 11.6% of the genetic variance in albumin level and the candidate genes ALDH7A1, GAPDHS, STRAP, MGTS1, EI24, HAMP, PTPRO, FFAR1, FFAR2, FFAR3, KIRREL2, ITGA8, NPHS1, TYROBP, MAG, DIABLO, PRODH2 and HPD were found. Seven genomic regions explained 12.4% of the genetic variance in urea level, and the candidate genes PCDH9, AZGP1, LAMTOR4, SMURF1, RAB31, ARPC1A, ARPC1B, CNTN1, PDZRN4, NDUFV2, CLOCK and NMU were identified. The genes found in the current study are involved in biological processes related to hepatic and renal functions and variants in these genes can be useful for breeding schemes in Santa Ines sheep.
Keywords: Albumina
Cordeiros
Metabolismo
Proteína
Melhoramento genético
metadata.dc.subject.cnpq: CNPQ::CIENCIAS AGRARIAS::ZOOTECNIA::GENETICA E MELHORAMENTO DOS ANIMAIS DOMESTICOS
metadata.dc.language: por
metadata.dc.publisher.country: Brasil
Publisher: UNIVERSIDADE FEDERAL DA BAHIA
metadata.dc.publisher.initials: UFBA
metadata.dc.publisher.department: Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
metadata.dc.publisher.program: Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO)
URI: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37972
Issue Date: 29-Apr-2019
Appears in Collections:Dissertação (PPGZOO)

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
Taiana Cortez de Souza - 29-04-2019.pdf872,94 kBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.