Skip navigation
Universidade Federal da Bahia |
Repositório Institucional da UFBA
Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37807
Tipo: Dissertação
Título: Identificação de microRNA diferencialmente expressos em pacientes com disfunção cardíaca decorrente de sepse e a correlação com as vias intracelulares de sinalização: análise in silico de potenciais biomarcadores de diagnóstico
Autor(es): Oliveira, Letícia Reis de
Primeiro Orientador: Macambira, Simone Garcia
metadata.dc.contributor.advisor-co1: Costa, Jaqueline França
metadata.dc.contributor.referee1: Figueiredo, Bárbara de Castro Pimentel
metadata.dc.contributor.referee2: Tavares, Natália Machado
metadata.dc.contributor.referee3: Macambira, Simone Garcia
Resumo: Introdução: A sepse é uma condição clínica com elevado risco de morte, definida como uma disfunção orgânica decorrente de uma resposta desregulada do hospedeiro à infecção, sendo a disfunção cardíaca uma das principais complicações dos pacientes com sepse e está intimamente associada à elevada mortalidade induzida por esta condição clínica. Atualmente, a incidência e a mortalidade da sepse ainda são elevadas, apontando a importância do uso de biomarcadores no diagnóstico precoce e no seu prognóstico. Nesse cenário, os microRNA surgem como candidatos potenciais com alta especificidade e sensibilidade para a sepse. Diante desse contexto, o presente estudo visou investigar o perfil de expressão dos miRNA e sua correlação com as vias intracelulares envolvidas no remodelamento do miocárdio decorrente da sepse. Métodos & Resultados : O levantamento dos transcriptomas publicamente disponíveis em NCBI, GEO e ENA, resultou na obtenção do conjunto de dados GSE171546. Este conjunto dispõe de 20 amostras : 5 compondo o grupo controle e 15 amostras constituindo o grupo com cardiomiopatia séptica, separadas nos intervalos de tempo: 24h, 48h e 72h. A importação e análise desse conjunto de dados foram feitas a partir da plataforma online do Galaxy. Foi então avaliado o valor de p <0,05 e Fold change para encontrar os Genes Diferencialmente Expressos (GDE) e microRNA Diferencialmente Expressos (MDE). A partir desta análise, 768 GDE foram encontrados no período de 24h, 312 no grupo 48h e 255 GDE no intervalo de 72h, além de dois MDE (miR-8110 e miR-574-5p). As análises de enriquecimento de vias e de ontologia genética foram feitas pelo Webgestalt. A verificação dos mRNA alvos dos MDE foi realizado através do Mirwalk e posterior construção de rede de interação entre GDE e MDE, no Cytoscape. Conclusão : Os dois miRNA identificados estão relacionados a diversas vias intracelulares envolvidas no remodelamento do miocárdio associado à disfunção cardíaca decorrente da sepse e estão diferencialmente modulados no transcriptoma analisado neste estudo, sugerindo um papel relevante como potenciais biomarcadores de prognóstico da cardiomiopatia decorrente da sepse.
Abstract: Introduction: Sepsis is a clinical condition with a high risk of death, defined as an organ dysfunction resulting from a dysregulated host response to infection, with cardiac dysfunction being one of the main complications in septic patients and closely associated with high mortality induced by this clinical condition. Currently, the incidence and mortality of sepsis remain high, highlighting the importance of using biomarkers for early diagnosis and prognosis. In this scenario, microRNAs emerge as potential candidates with high specificity and sensitivity for sepsis. In light of this context, the present study aimed to investigate the expression profile of miRNAs and their correlation with intracellular pathways involved in myocardial remodeling associated with sepsis. Methods & Results: Surveying publicly available transcriptomes in NCBI, GEO dataset, and ENA resulted in obtaining the dataset GSE171546. This dataset comprises 20 samples: 5 in the control group and 15 samples in the septic cardiomyopathy group, divided into three time intervals: 24h, 48h, and 72h. Importation and analysis of this dataset were performed using the online Galaxy platform. The p-value <0.05 and fold change were evaluated to identify Differentially Expressed Genes (DEGs) and Differentially Expressed microRNAs (DEMs). From this analysis, 768 DEGs were found at the 24h time point, 312 in the 48h group, and 255 DEGs in the 72h interval, along with two DEMs (miR-8110 and miR-574-5p). Pathway enrichment analysis and gene ontology were performed using Webgestalt. The validation of target mRNAs of DEMs was carried out through Mirwalk, followed by the construction of an interaction network between DEGs and DEMs using Cytoscape. Conclusion: The two identified microRNAs are related to various intracellular pathways involved in myocardial remodeling associated with cardiac dysfunction resulting from sepsis and are differentially modulated in the transcriptome analyzed in this study, suggesting a relevant role as potential prognostic biomarkers for sepsis-induced cardiomyopathy.
Palavras-chave: Sepse
Disfunção cardíaca
Expressão gênica
Biomarcadores
CNPq: CIÊNCIAS DA SAÚDE
CIÊNCIAS BIOLÓGICAS
Idioma: por
País: Brasil
Editora / Evento / Instituição: Universidade Federal da Bahia
Sigla da Instituição: UFBA
metadata.dc.publisher.department: Instituto de Ciências da Saúde - ICS
metadata.dc.publisher.program: Programa de Pós-Graduação em Imunologia - (PPGIM) 
Tipo de Acesso: CC0 1.0 Universal
metadata.dc.rights.uri: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
URI: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37807
Data do documento: 13-Jul-2023
Aparece nas coleções:Tese (PPGIM)

Arquivos associados a este item:
Arquivo Descrição TamanhoFormato 
LETICIA MESTRADO - UFBA .pdfDISSERTAÇÃO DE MESTRADO2,31 MBAdobe PDFVisualizar/Abrir
Mostrar registro completo do item Visualizar estatísticas


Este item está licenciada sob uma Licença Creative Commons Creative Commons