https://repositorio.ufba.br/handle/ri/35651| Tipo: | Tese |
| Título: | Estudo de varredura genômica para a resposta ao agonista β2 de curta ação em pacientes com asma |
| Título(s) alternativo(s): | Gwas for response to short-acting β2 agonist in patients with asthma |
| Autor(es): | Teixeira, Helena Mariana Pitangueira |
| Primeiro Orientador: | Figueiredo, Camila Alexandrina |
| metadata.dc.contributor.advisor-co1: | Costa, Ryan dos Santos |
| metadata.dc.contributor.referee1: | Silva, Thiago Magalhaes da |
| metadata.dc.contributor.referee2: | Costa, Giselle Calasans de Souza |
| metadata.dc.contributor.referee3: | Soares, Denis Melo |
| metadata.dc.contributor.referee4: | Pedreira, Joice Neves Reis |
| metadata.dc.contributor.referee5: | Marques, Cintia Rodrigues |
| Resumo: | Introdução: A asma geralmente é caracterizada pela inflamação crônica das vias aéreas, cuja obstrução pode ser reversível com o uso de broncodilatadores (BD). No entanto, indivíduos com asma que não respondem ao tratamento pode, ao menos em parte, ser explicado pela variabilidade genética. Objetivos: Identificar possíveis loci farmacogenéticos relacionados à resposta ao broncodilatador (BDR) em uma população com asma. Métodos: Realizamos um GWAS, com 716 indivíduos com asma, para identificar as variantes associadas à BDR, através da variação percentual do FEV1 após o uso do salbutamol. As variantes foram genotipadas usando chip MEGA (Illumina) com posterior imputação com painel de referência do CAAPA (Consórcio sobre Asma entre Populações com Ancestralidade Africana). Foram realizadas análises de enriquecimento de vias através do VEGAS2 e GARFIELD. Adicionalmente, foi realizada a quantificação de citocinas no sangue periférico através da tecnologia de Luminex e células T regulatórias produtoras de IL-10 foram avaliadas através de citometria de fluxo. Resultados: Vinte e seis variantes foram sugestivamente associadas (5x10-8<p-value<1x10-5) com BDR; três regiões (PTPRC, PRKCH e WWOX) foram relacionadas usando análise baseada em vias e estão ligadas a mecanismos imunológicos. Os sinais independentes no rs3754098-T (OR (odds ratio): 2.21, IC95% (intervalo de confiança):1.57-3.12), (PTPRC), foram associados com melhor BDR e maiores níveis de IL-10 no sangue. O rs14095-G (OR:2.15, CI95%:1.60-2.87) (PRKCH); o rs76893638-T (OR:4.26, CI95%:2.43-7.47) (MYLIP); e variantes rs7630434-C (OR:2.33, CI95%:1.67-3.27) (WWTR1) foram associadas a um melhor BDR, enquanto rs2250772-C (OR:0.53, CI95%:0.40-0.70) (PRKCH) e rs75376533-C (OR:0.23, IC95%:0.13-0.42) (WWOX) foram associados a um pior BDR. Entre tais regiões, 2 variantes localizadas no gene WWTR1 e WWOX foram replicadas em latinos de GALA II na mesma direção da população descoberta. Conclusões: Este trabalho sugere que genes associados a mecanismos imunológicos e fisiológicos podem influenciar a resposta ao broncodilatador em pacientes com asma. Nosso estudo expande a compreensão da farmacogenética da resposta medicamentosa em asma, fornecendo potencialmente novos alvos moleculares associados ao BDR e avança o conhecimento para a medicina de precisão na terapia da asma em populações miscigenadas como a brasileira. |
| Abstract: | Introduction: Asthma is usually characterized by chronic inflammation of the airways, whose obstruction can be reversible with the use of bronchodilators (BD). However, individuals with asthma do not respond to treatment, which can, at least in part, be explained by genetic variability. Objectives: To identify possible pharmacogenetic loci related to bronchodilator response (BDR) in a population with asthma. Methods: We performed a GWAS, with 716 individuals with asthma, to identify the variants associated with BDR, through the percentage variation of FEV1 after the use of albuterol. The variants were genotyped using a MEGA chip (Illumina) with subsequent imputation with the CAAPA (Consortium on Asthma among Populations of African Ancestry) reference panel. Pathway enrichment analyzes were performed using VEGAS2 and GARFIELD. Additionally, peripheral blood cytokine quantification was performed using Luminex technology and IL-10-producing regulatory T cells were evaluated by flow cytometry. Results: Twenty-six variants were suggestively associated (5x10-8<p-value<1x10-5) with BDR; three regions (PTPRC, PRKCH, and WWOX) were related using pathways-based analysis and are linked to immunological mechanisms. The independent signals in the rs3754098-T (OR (odds ratio):2.21, CI95% (confidence interval):1.57-3.12), (PTPRC), were associated with better BDR and higher levels of IL-10 in blood. The rs14095-G (OR:2.15, CI95%:1.60-2.87) (PRKCH); the rs76893638-T (OR:4.26, CI95%:2.43-7.47) (MYLIP); and rs7630434-C (OR:2.33, CI95%:1.67-3.27) (WWTR1) variants were associated with a better BDR, whereas rs2250772-C (OR:0.53, CI95%:0.40-0.70) (PRKCH) and rs75376533-C (OR:0.23, CI95%:0.13-0.42) (WWOX) were associated with a worse BDR. Among such regions, 2 variants located at WWTR1 and WWOX gene were replicated in Latinos from GALA II in the same direction as the discovery population. Conclusions: This work suggests that genes associated with immunological and physiological mechanisms may influence the bronchodilator response in patients with asthma. Our study expands the understanding of the pharmacogenetics of drug response in asthma, potentially providing new molecular targets associated with BDR and advances knowledge for precision medicine in asthma therapy in mixed populations such as Brazil. |
| Palavras-chave: | GWAS BDR Asma IL-10 Imunogenética Farmacogenética Broncodilatador |
| CNPq: | Ciências Biológicas III |
| Idioma: | por |
| País: | Brasil |
| Editora / Evento / Instituição: | Universidade Federal da Bahia |
| Sigla da Instituição: | UFBA |
| metadata.dc.publisher.department: | Instituto de Ciências da Saúde - ICS |
| metadata.dc.publisher.program: | Programa de Pós-Graduação em Imunologia - (PPGIM) |
| Tipo de Acesso: | Acesso Restrito |
| URI: | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/35651 |
| Data do documento: | 6-Mai-2022 |
| Aparece nas coleções: | Tese (PPGIM) |
| Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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