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Universidade Federal da Bahia |
Repositório Institucional da UFBA
Use este identificador para citar ou linkar para este item: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/34685
Tipo: Dissertação
Título: Detecção molecular de arbovirus emergentes: West Nile, Saint Louis e Mayaro
Autor(es): Rolo, Carolina de Araújo
Primeiro Orientador: Campos, Gubio Soares
metadata.dc.contributor.advisor-co1: Sardi, Silvia Inês
metadata.dc.contributor.referee1: Campos, Gubio Soares
metadata.dc.contributor.referee2: Pires, Acássia Benjamim Leal
metadata.dc.contributor.referee3: Pacheco, Luis Gustavo Carvalho
Resumo: As arboviroses são doenças virais transmitidas por vetores artrópodes, especialmente mosquitos do gênero Aedes e Culex. Estas doenças estão dispersas por todo o mundo e causam grandes impactos na saúde e na economia. No Brasil existem diversas arboviroses em circulação, como zika (ZIKV) e dengue (DENV). Algumas arboviroses são consideradas emergentes, como mayaro (MAYV), vírus da encefalite de Saint Louis (SLEV) e vírus do oeste do Nilo (WNV). Apesar de terem sido detectadas no Brasil e terem potencial para causar epidemias, estas arboviroses ainda não se disseminaram dentro do território brasileiro. Por conta de características geográficas e sociais, o Brasil apresenta o ambiente ideal para dispersão de arboviroses. Diante deste contexto, foram desenvolvidos ensaios de PCR em tempo real (qPCR) para detecção dos vírus SLEV e MAYV. Para padronização do qPCR foi empregado um plasmídeo contendo as sequências dos referidos vírus e, a partir destas sequências, foram desenhados os iniciadores e sondas. Para o ensaio de MAYV foi possível obter 96,39% de eficiência e, no que diz respeito a sensibilidade, detecção de uma cópia de RNA viral. Quanto ao ensaio de SLEV, foi obtida uma eficiência de 104,67% e sensibilidade para detecção de uma cópia de RNA viral. Em relação a especificidade, ambos os ensaios se mostraram específicos para os vírus de interesse. Os ensaios padronizados para SLEV e MAYV apresentaram eficiência, especificidade e sensibilidade dentro dos padrões determinados para qPCR, sendo adequado seu uso na rotina diagnóstica laboratorial.
Abstract: Arboviruses are viral diseases transmitted by arthropod vectors, especially mosquitoes of the Culex and Aedes genus. These diseases are spread across the world and have major impacts on health and the economy. In Brazil there are several arboviruses in circulation, such as Zika (ZIKV) and dengue (DENV). Some arboviruses are considered emerging, such as mayaro (MAYV), Saint Louis encephalitis virus (SLEV) and West Nile virus (WNV). Despite having been detected in Brazil and having the potential to cause epidemics, these arboviruses have not yet spread within Brazilian territory. Due to geographic and social characteristics, Brazil presents the ideal environment for the dispersion of arboviruses. In this context, real-time PCR assays (qPCR) were developed to detect SLEV and MAYV viruses. To standardize the qPCR, a plasmid containing the sequences of these viruses was used and, from these sequences, primers and probes were designed. For the MAYV assay it was possible to obtain 96.39% efficiency and, with regard to sensitivity, detection of one single viral RNA copy. As for the SLEV assay, an efficiency of 104.67% and sensitivity for detecting one single viral RNA copy were obtained. Regarding specificity, both assays were specific for the virus of interest. The standardized assays for SLEV and MAYV showed efficiency, specificity and sensitivity within the standards determined for qPCR, being suitable for use in routine laboratory diagnostics.
Palavras-chave: Diagnóstico
Arbovírus
RT-qPCR
Emerging arboviruses
Diagnosis
CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA::MICROBIOLOGIA MEDICA
Idioma: por
País: Brasil
Editora / Evento / Instituição: Universidade Federal da Bahia
Sigla da Instituição: UFBA
metadata.dc.publisher.department: Instituto de Ciências da Saúde - ICS
metadata.dc.publisher.program: Programa de Pós-graduação em Biotecnologia (PPGBiotec) 
Tipo de Acesso: Acesso Aberto
URI: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/34685
Data do documento: 4-Nov-2021
Aparece nas coleções:Dissertação (PPGBiotec)

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