Campo DC | Valor | Idioma |
dc.creator | Machado, Gabriel Jeferson Rodríguez | - |
dc.date.accessioned | 2023-06-26T20:16:06Z | - |
dc.date.available | 2023-06-26T20:16:06Z | - |
dc.date.issued | 2023-03-31 | - |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ufba.br/handle/ri/37266 | - |
dc.description.abstract | Introduction: Although it is a rare malignancy in the pediatric population, thyroid cancer, at
this stage of life, is associated with advanced stages of the disease when compared to
adulthood. The papillary type represents 80 to 90% of all thyroid carcinomas derived from
follicular cells and presents a high rate of mutations and gene fusions, capable of influencing
the clinical and biological behavior of the tumor. RET fusions are identified as important
markers of tumor aggressiveness in the pediatric population, however, due to some factors,
their frequency is highly variable. Objective: To retrospectively determine the frequency of
RET gene fusions in paraffin-embedded samples of differentiated thyroid carcinoma from
children, adolescents and young adults (<21 years) treated at the participating centers in the
study. Material and methods: Retrospective, cross-sectional study with 79 cases of
differentiated thyroid carcinoma, treated in four reference centers in the northeast region of
Brazil, between January 2010 and March 2021. DNA was extracted from paraffin-embedded
samples and directed to analysis through next-generation sequencing, where it was submitted
to the HotSpot panel to determine point mutations, and to the Fusion panel to identify gene
fusions. Results: Initially, five samples previously positive for the BRAFV600E mutation were
detected and, as it is a genetic alteration that excludes RET/PTC rearrangements, they were
not followed up with the evaluation of positivity for gene fusions. The HotSpot result showed
21/79 (26.6%) inconclusive results, 21/79 (26.6%) mutated and 37/79 (46.8%) wild type.
Among the mutated, 10/21 (47.6%) cases were positive for BRAF mutation, 08/21 (38.1%)
for EGFR, 04/21 (19.0%) for KRAS, 03/21 (14 .3%) for NRAS and 01/21 (4.8%) for PIK3CA,
with occurrence of simultaneous point mutations. As for molecular analysis to detect gene
fusions, 39/74 (52.7%) had inconclusive results, 10/74 (13.5%) were positive for a
rearrangement and 25/74 (33.8%) were classified as wild type. Among the positive cases for
gene fusions, 03 were of the RET gene (01 CCDC6::RET or RET/PTC1, 01 NCOA4::RET or
RET/PTC3, and 01 TRIM24::RET or RET/PTC6); 04 were from the NTRK gene (03
ETV6::NTRK3 and 01 TPR::NTRK1); 02 PAX8::PPARG merges; and 01 STRN::ALK.
Conclusion: In our study, the frequency of RET fusions was 8.6% (03/35), and younger
individuals (<18 years) had a higher frequency of gene rearrangements, but the high rate of
inconclusive results does not allow establishing the association of individuals with clinicalpathological aspects. Furthermore, BRAF gene mutations were the most frequent in the
HotSpot panel, followed by EGFR, KRAS, NRAS and PIK3CA. | pt_BR |
dc.language | por | pt_BR |
dc.publisher | Universidade Federal da Bahia | pt_BR |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil | * |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/ | * |
dc.subject | câncer de tireoide | pt_BR |
dc.subject | criança | pt_BR |
dc.subject | juventude | pt_BR |
dc.subject | translocação genética | pt_BR |
dc.subject | sequenciamento de nova geração | pt_BR |
dc.subject.other | thyroid neoplasms | pt_BR |
dc.subject.other | child | pt_BR |
dc.subject.other | youth | pt_BR |
dc.subject.other | translocation | pt_BR |
dc.subject.other | next generation sequencing | pt_BR |
dc.title | Fusões do gene RET em painel multigênico para câncer de tireoide numa população infantojuvenil | pt_BR |
dc.title.alternative | RET gene fusions in a multigene panel for thyroid cancer in a juvenile population | pt_BR |
dc.type | Dissertação | pt_BR |
dc.publisher.program | Programa de Pós-Graduação em Processos Interativos dos Órgãos e Sistemas (PPGORGSISTEM) | pt_BR |
dc.publisher.initials | UFBA | pt_BR |
dc.publisher.country | Brasil | pt_BR |
dc.subject.cnpq | CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::GENETICA | pt_BR |
dc.contributor.advisor1 | Ramos, Helton Estrela | - |
dc.contributor.advisor1ID | https://orcid.org/0000-0002-2900-2099 | pt_BR |
dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5624505454133902 | pt_BR |
dc.contributor.advisor-co1 | Cerqueira, Taíse Lima de Oliveira | - |
dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/0365632293236220 | pt_BR |
dc.contributor.referee1 | Ramos, Helton Estrela | - |
dc.contributor.referee1ID | https://orcid.org/0000-0002-2900-2099 | pt_BR |
dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/5624505454133902 | pt_BR |
dc.contributor.referee2 | Vilas Bôas, Deise Souza | - |
dc.contributor.referee2Lattes | http://lattes.cnpq.br/0177658625383087 | pt_BR |
dc.contributor.referee3 | Fuziwara, Cesar Seigi | - |
dc.contributor.referee3ID | https://orcid.org/0000-0002-0567-5432 | pt_BR |
dc.contributor.referee3Lattes | http://lattes.cnpq.br/3939813787288240 | pt_BR |
dc.creator.ID | https://orcid.org/0000-0002-0960-0120 | pt_BR |
dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/0079100115582016 | pt_BR |
dc.description.resumo | Introdução: O câncer de tireoide, embora seja uma rara malignidade na população pediátrica,
nessa fase da vida está associado a estágios avançados da doença, quando comparado à fase
adulta. O tipo papilífero representa 80 a 90% de todos os carcinomas tireoidianos derivados
de células foliculares e apresenta alta taxa de mutações e fusões gênicas, capazes de
influenciar o comportamento clínico e biológico do tumor. As fusões RET são apontadas
como importantes marcadores de agressividade tumoral na população pediátrica, entretanto,
devido a alguns fatores, a sua frequência é altamente variável. Objetivo: Determinar,
retrospectivamente, a frequência de fusões do gene RET em amostras parafinadas de
carcinoma diferenciado de tireoide em crianças, adolescentes e adultos jovens (<21 anos),
atendidos nos centros participantes do estudo. Material e métodos: Estudo retrospectivo, de
corte transversal, com 79 casos de carcinoma diferenciado de tireoide, tratados em quatro
centros de referência da região Nordeste do Brasil, entre janeiro de 2010 e março de 2021. O
DNA foi extraído das amostras parafinadas e direcionado para análise mediante
sequenciamento de nova geração, onde foi submetido ao painel HotSpot, para determinação
de mutações pontuais, e ao painel Fusion para identificação de fusões gênicas. Resultados:
Inicialmente, detectaram-se cinco amostras previamente positivas para a mutação BRAFV600E
e, por tratar-se de uma alteração genética excludente para rearranjos RET/PTC, não seguiram
para a avaliação de positividade para fusões gênicas. O resultado HotSpot apontou 21/79
(26,6%) resultados inconclusivos, 21/79 (26,6%) mutados e 37/79 (46,8%) tipo selvagem.
Entre os mutados, 10/21 (47,6%) casos foram positivos para mutação em BRAF, 8/21 (38,1%)
para EGFR, 04/21 (19,0%) para KRAS, 03/21 (14,3%) para NRAS e 01/21 (4,8%) para
PIK3CA, com ocorrência de mutações pontuais simultâneas. Quanto à análise molecular para
detecção de fusões gênicas, 39/74 (52,7%) tiveram resultados inconclusivos, 10/74 (13,5%)
apresentaram positividade para um rearranjo e 25/74 (33,8%) foram classificados como tipo
selvagem. Dentre os casos positivos para fusões gênicas, 3 foram do gene RET (1
CCDC6::RET ou RET/PTC1, 1 NCOA4::RET ou RET/PTC3, e 1 TRIM24::RET ou
RET/PTC6); 4 foram do gene NTRK (3 ETV6::NTRK3 e 1 TPR::NTRK1); 2 fusões
PAX8::PPARG; e 1 STRN::ALK. Conclusão: A frequência de fusões RET foi de 8,6% (03/35)
e indivíduos mais jovens (<18 anos) apresentaram maior frequência de rearranjos gênicos,
porém, o alto índice de resultados inconclusivos não permite estabelecer a associação das
mutações com aspectos clínico-patológicos. Além disso, as mutações no gene BRAF foram as
mais frequentes no painel HotSpot, seguidas por EGFR, KRAS, NRAS e PIK3CA. | pt_BR |
dc.publisher.department | Instituto de Ciências da Saúde - ICS | pt_BR |
dc.type.degree | Mestrado Acadêmico | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Dissertação (PPGPIOS)
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