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dc.creatorVon Ammon, Juliana Lima-
dc.date.accessioned2023-03-10T13:19:12Z-
dc.date.available2023-03-10T13:19:12Z-
dc.date.issued2022-12-21-
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufba.br/handle/ri/36722-
dc.description.abstractIntroduction: Follicular cell-derived thyroid carcinoma (FCDTC) constitutes the majority of thyroid neoplasms, accounting for almost 90% of cases. The tumor molecular profile analysis, through the technique of next generation sequencing (NGS), has been essential for the tracking of actionable mutations in cancer and, consequently, in the identification of cases that may evolve to a more aggressive behavior of the disease. The clinical management of FCDTC has evolved due to a better understanding of the impacts of genetic alterations reported on the main gene drivers involved in the hyperactivation of the MAPK and PI3K-AKT pathways. However, the clinicopathological correlation of these genetic alterations is still poorly understood, especially in patients from Latin America. Objectives: To correlate clinicopathological aspects of FCDTC in adult patients with mutations through a customized multigenic panel. Material and Methods: Retrospective, cross-sectional, unicentric study, involving 100 adult patients diagnosed with FCDTC, between 2010 and 2019, at Hospital Aristides Maltez in Salvador, Bahia. The anatomopathological data were reviewed by a pathologist. Paraffinized tumor DNA was extracted with the ReliaPrep™ FFPE gDNA Miniprep System (Promega, USA). Genotyping of target genomic regions (KRAS, NRAS, BRAF, EGFR and PIK3CA) was performed using the customized Ampliseq panel and sequencing performed on the iSeq™ 100 platform (Illumina®, USA). Bioinformatics analyzes were performed on the cloud-based Varstation™ platform. Results: After performing the NGS technique, 54/100 (54%) presented satisfactory results, and 46/100 (46%) samples presented inconclusive results. Through our customized mutational panel, 31/54 (57%) of the samples had mutations in the analyzed genes, 83% of classic papillary subtype (CPTC), mean age of 34 years, 83% female, and mean tumor size of 2.21 cm. 23/54 (42.6%) did not present any mutation (wild). Mutations in the BRAF gene were the most frequent (≥58% of the mutations found), most of them present in CPTC. 10/54 (18%) samples had the BRAFV600E mutation, and surprisingly, we found 7 BRAFNO-V600E mutations not yet described in FCDTC (G464E, G464R, G466E, S467L, G469E, G596D and the T599Ifs*10 deletion) and the BRAFA598V mutation previously reported. BRAFG464E and BRAFG596D were detected in two cribform morular CT cases, BRAFG466E, BRAFG469E, BRAFG464R and BRAFA598V were present in CPTC, the BRAFT599Ifs*10 deletion observed in a solid variant of CPT, and BRAFS467L was present in one case of an infiltrative follicular variant from CPT and CPTC; all samples with absence of extrathyroidal extension (ETE). Mutations in the EGFR gene were found in 16/54 (29%) of the tumor samples, all of the CPTC subtype, and in the RAS genes (KRAS and NRAS), 8/54 (14%) mutations were found. No mutations were found in the PIK3CA gene. Interestingly, 12 samples had multiple mutations: 3 (BRAFV600/EGFR), 3 (BRAFNO-V600/EGFR), 2 (BRAFV600/BRAFNO-V600), 3 (BRAF/RAS), with 1 CPTC sample with 4cm and ETE present presented three mutations simultaneously in the KRASD119N, NRASQ61* and EGFRH850Rfs*26 genes. Conclusion: In this study, no significant association was found between FCDTC and BRAFV600E, KRAS, NRAS and EGFR mutations. However, the BRAFNO-V600E variants were significantly evident and associated with a lower risk of ETE. The findings of this study bring the relevance of carrying out a multigene panel by NGS in cases of FCDTC, with the purpose of expanding knowledge about the frequency and impacts of genetic alterations associated with this pathology.pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal da Bahiapt_BR
dc.rightsAttribution-NonCommercial-NoDerivs 3.0 Brazil*
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/br/*
dc.subjectNeoplasias da glândula tireoidept_BR
dc.subjectSequenciamento de Nova Geraçãopt_BR
dc.subjectProteínas proto-oncogênicas B-rafpt_BR
dc.subjectMutaçãopt_BR
dc.subject.otherThyroid Neoplasmspt_BR
dc.subject.otherNext-generation sequencingpt_BR
dc.subject.otherProto-oncogene Proteins B-rafpt_BR
dc.subject.othermutationpt_BR
dc.titleASPECTOS CLÍNICO-PATOLÓGICOS E PAINEL MULTIGÊNICO NO CARCINOMA DE TIREOIDE DERIVADO DE CÉLULAS FOLICULARESpt_BR
dc.title.alternativeClinicopathological aspects and multigene panel in follicular cell-derived thyroid carcinomapt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Processos Interativos dos Órgãos e Sistemas (PPGORGSISTEM) pt_BR
dc.publisher.initialsUFBApt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASpt_BR
dc.contributor.advisor1Ramos, Helton Estrela-
dc.contributor.advisor1ID0000-0002-2900-2099pt_BR
dc.contributor.advisor-co1Cerqueira, Taise Lima de Oliveira-
dc.contributor.referee1Carletto, Tatiane de Oliveira Teixeira Muniz-
dc.contributor.referee2Penna, Gustavo Cancela e-
dc.contributor.referee3Ramos, Helton Estrela-
dc.creator.ID0000-0002-8513-992Xpt_BR
dc.creator.Latteshttps://lattes.cnpq.br/8931372324044952pt_BR
dc.description.resumoIntrodução: O carcinoma de tireoide derivado de células foliculares (CTDCF) constitui a maioria das neoplasias da tireoide, correspondendo a quase 90% dos casos. A análise do perfil molecular tumoral, através da técnica de sequenciamento de nova geração (SNG), vem sendo essencial para o rastreamento de mutações acionáveis do câncer e, consequentemente, na identificação dos casos que podem evoluir para um comportamento mais agressivo da doença. O manejo clínico do CTDCF vem evoluindo devido a uma melhor compreensão dos impactos das alterações genéticas relatadas nos principais drivers gênicos envolvidos na hiperativação das vias MAPK e PI3K-AKT. No entanto, a correlação clínico-patológica dessas alterações genéticas ainda é pouco compreendida, sobretudo em pacientes da América Latina. Objetivos: Correlacionar aspectos clínico-patológicos do CTDCF em pacientes adultos com mutações através de um painel multigênico customizado. Material e Métodos: Estudo retrospectivo, transversal, unicêntrico, envolvendo 100 pacientes adultos diagnosticados com CTDCF, entre 2010 e 2019, no Hospital Aristides Maltez em Salvador, Bahia. Foi realizada revisão anatomopatológica por patologista colaborador. DNA tumoral parafinado foi extraído com o ReliaPrep™ FFPE gDNA Miniprep System (Promega, EUA). Genotipagem das regiões genômicas alvos (KRAS, NRAS, BRAF, EGFR e PIK3CA) foram realizadas através do painel Ampliseq personalizado, e o sequenciamento realizado na plataforma iSeq™ 100 (Illumina®, EUA). Análises de bioinformática foram realizadas na plataforma Varstation™ baseada em nuvem. Resultados: Realizada a técnica de SNG, 54/100 (54%) apresentaram resultado satisfatório, e 46/100 (46%) amostras apresentaram resultado inconclusivo. Através do nosso painel mutacional customizado, 31/54 (57%) das amostras apresentaram mutações nos genes analisados, 83% de subtipo papilífero clássico (CPTC), idade média de 39 anos, 87% do sexo feminino, e média do tamanho tumoral de 2,14 cm. 23/54 (42,6%) não apresentaram nenhuma mutação (selvagem). As mutações no gene BRAF foram as mais frequentes 18/54 (33%), detectadas em maioria no CPTC. 10/54 (18%) amostras apresentaram a mutação BRAFV600E, e encontramos 7 mutações BRAFNO-V600E ainda não descritas em CTDCF (G464E, G464R, G466E, S467L, G469E, G596D e a deleção T599Ifs*10) e a mutação BRAFA598V já previamente reportada. A BRAFG464E e BRAFG596D foram detectadas em dois casos CT cribforme morular, a BRAFG466E, BRAFG469E, BRAFG464R e BRAFA598V estiveram presentes em CPTC, a deleção BRAFT599Ifs*10 observada em uma variante sólida de CPT, e a BRAFS467L esteve presente em um caso de variante folicular infiltrativa de CPT e em CPTC; todas as amostras com ausência de extensão extratireoidiana (EET). Mutações no gene EGFR foram encontradas em 16/54 (29%) das amostras tumorais, todas do subtipo CPTC, e nos genes RAS (KRAS e NRAS) foram encontradas 8/54 (14%) mutações. Não foram encontradas mutações no gene PIK3CA12, amostras tiveram múltiplas mutações: 3 (BRAFV600/EGFR), 3 (BRAFNO-V600/EGFR), 2 (BRAFV600/ BRAFNO-V600), 3 (BRAF/RAS), sendo que 1 amostra de CPTC, tumor de 4cm e EET presente apresentou 3 mutações simultaneamente nos genes KRASD119N, NRASQ61* e EGFRH850Rfs*26. Conclusão: Neste estudo, não foi encontrada associação significativa entre CTDCF e as mutações BRAFV600E, KRAS, NRAS e EGFR. Entretanto, as variantes BRAFNO-V600E foram significativamente evidentes e associadas a um menor risco de EET. Os achados deste estudo trazem a relevância da realização de um painel multigênico por SNG nos casos de CTDCF, com a finalidade em expandir o conhecimento sobre a frequência e os impactos das alterações genéticas associadas a essa patologia.pt_BR
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências da Saúde - ICSpt_BR
dc.relation.referencesVon Ammon JL. Aspectos clínico-patológicos e painel multigênico no carcinoma de tireoide derivado de células foliculares [dissertação]. Salvador: Processos Interativos de Órgãos e Sistemas, Instituto de Ciências da Saúde, Universidade Federal da Bahia; 2022. 90 p.pt_BR
dc.type.degreeMestrado Acadêmicopt_BR
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