Polimorismos nos genes LEP, GH, IGF1, CAPN1 E CAST associados com características de crescimento e carcaça em ovinos Santa Inês

Abstract

O objetivo deste estudo foi identificar associação entre polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP e características de interesse econômico em 192 ovinos Santa Inês. Peso vivo aos 100 (P100) e 240 dias (P240) dias de idade, as alturas na cernelha (AC) e na garupa (AG), o comprimentos do corpo (CC), os perímetros do tórax (PT) e da perna (PP), as larguras do tórax (LP) e da garupa (LG), a profundidade de corpo (PC), a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS) e o escore de terminação de carcaça (ETC) foram os fenótipos avaliados. Um total de 112 polimorfismos foram testados, sendo 25 no CAPN1, 42 no CAST, 16 no GH, 11 no IGF1 e 18 no LEP. Cada marcador foi testado individualmente e por fim uma abordagem de haplótipos também foi conduzida. Vinte e três associações foram detectadas entre SNPs no gene CAST e as variáveis P100, P240, ETC, EGS, PT e LT. Além disso, efeitos de haplótipos no gene CAST sobre AOL, GMD, PT, CC e PP foram encontrados. Para os SNPs no CAPN1, sete efeitos aditivos sobre P100, AG, AC, PC, EGS e AOL foram encontrados, enquanto a análise de associação por haplótipos detectou efeito sobre EGS. O SNP g.47486819C>A localizado no GH foi associado com P100, enquanto o SNP g.171110428C>T no IGF1 foi associado com AC, AG, LT, PP e GMD. Os SNPs localizados no gene LEP (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) foram associados com ETC, AG e EGS. Além disso, os SNPs g.92502623G>C e g.92502947A>C no LEP foram associados com ETC e AG. A análise da associação por haplótipos também revelou sete e três associações significativas após correção Bonferroni no IGF1 e LEP, respectivamente. Portanto, o presente estudo identificou polimorfismos nos genes CAPN1, CAST, GH, IGF1 e LEP associados a variáveis de crescimento e de carcaça em ovinos Santa Inês, os quais podem ser fontes de informação para a seleção assistida por marcadores.

This study aimed to identify association between polymorphisms in CAPN1, CAST, GH, IGF1, and LEP genes and phenotypic traits in 192 Santa Ines lambs. Body weight at 100 (BW100) and 240 days (BW240), average daily gain (ADG) between 100 and 240 days, withers (WH) and croup (CH) heights, body length (BL), thoracic (TG) and leg (LG) girths, thoracic (TW) and croup (CW) widths, body depth (BD), rib eye area (REA), fat thickness (FT), and carcass finish score (CFS) were evaluated. A total of 112 polymorphisms were tested, 25 in CAPN1, 42 in CAST, 16 in GH, 11 in IGF1, and 18 in LEP. Each marker was tested individually and finally a haplotype association approach was also conducted. Twenty-three associations were detected between SNPs in the CAST gene and BW100, BW240, CFS, FT, TG and TW. In addition, effects of haplotypes on the CAST gene on REA, ADG, TG, BD and LG were found. For the SNPs in CAPN1, seven additive effects on BW100, WH, CH, BD, FT and REA were found, while haplotype association analysis detected an effect on FT. The SNP g.47486819C>A in GH was associated with BW100, whereas the SNP g.171110428C>T on IGF1 was associated with WH, CH, TW, LG and ADG. The SNPs located in LEP gene (g.92501407C>T, g.92502245A>G, g.92502283T>C, g.92503024G>A, g.92503025C>T, g.92503086G>A) were associated with CFS, CH and FT. In addition, the SNPs g.92502623G>C and g.92502947A>C in LEP were associated with CFS and CH. Haplotype association analysis also revealed seven and three significant associations after Bonferroni correction in IGF1 and LEP, respectively. Therefore, the present study identified polymorphisms in CAPN1, CAST, GH, IGF1 and LEP genes associated with growth and carcass traits in Santa Ines sheep, which may be sources of information for marker-assisted selection.